Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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PMS2P11Q13670 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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PMS2P11Q13670 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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PMS2P11Q13670 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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