Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms