Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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