Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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