Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNA1Q09470 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms