Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms