Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms