Protein–RNA interactions for Protein: P80162

CXCL6, C-X-C motif chemokine 6, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL6P80162 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms