Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFNP31947 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFNP31947 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFNP31947 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFNP31947 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFNP31947 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SFNP31947 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFNP31947 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFNP31947 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFNP31947 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFNP31947 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFNP31947 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFNP31947 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFNP31947 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFNP31947 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFNP31947 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFNP31947 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFNP31947 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFNP31947 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFNP31947 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms