Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms