Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CTRB1P17538 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CTRB1P17538 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTRB1P17538 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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