Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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