Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTSLP07711 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTSLP07711 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTSLP07711 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSLP07711 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSLP07711 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTSLP07711 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms