Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms