Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9YO00507 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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