Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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