Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms