Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD3Q9P035 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms