Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms