Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms