Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms