Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms