Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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