Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP53INP1Q96A56 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms