Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CSNK2A3Q8NEV1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CSNK2A3Q8NEV1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CSNK2A3Q8NEV1 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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