Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms