Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms