Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ISXQ2M1V0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms