Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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ZNF239Q16600 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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ZNF239Q16600 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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