Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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