Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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