Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP4Q15650 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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