Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
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