Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
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