Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PEX6Q13608 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PEX6Q13608 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PEX6Q13608 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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