Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms