Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms