Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms