Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms