Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms