Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPAP53621 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
COPAP53621 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPAP53621 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms