Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms