Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms