Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms