Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms