Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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PTPRAP18433 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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PTPRAP18433 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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PTPRAP18433 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
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PTPRAP18433 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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PTPRAP18433 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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PTPRAP18433 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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PTPRAP18433 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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