Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4FO95754 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms