Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH16O75309 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH16O75309 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH16O75309 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH16O75309 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH16O75309 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH16O75309 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH16O75309 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH16O75309 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH16O75309 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH16O75309 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH16O75309 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH16O75309 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH16O75309 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH16O75309 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH16O75309 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH16O75309 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH16O75309 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms