Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms