Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FABP7O15540 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FABP7O15540 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FABP7O15540 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FABP7O15540 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FABP7O15540 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FABP7O15540 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FABP7O15540 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms